Nübel pindah dari FC Schalke 04 ke klub juara terbanyak di Jerman tersebut pada tahun 2020 tanpa biaya transfer, namun tidak pernah melampaui peran sebagai cadangan Manuel Neuer. Hingga saat ini, ia baru tampil dalam empat pertandingan resmi untuk klub asal Munich tersebut. Lima tahun terakhir ia habiskan dengan status pinjaman di AS Monaco (2021 hingga 2023) dan di VfB Stuttgart (2023 hingga 2026).
Di klub asal Swabia itu, Nübel tampil sangat baik dan selalu menunjukkan dirinya sebagai penjaga gawang yang dapat diandalkan. Bersama VfB, ia menjuarai DFB-Pokal, menjadi runner-up liga, dan bermain di kompetisi internasional (Liga Champions dan Liga Europa) selama dua tahun terakhir. Meskipun ada upaya, terutama dari pelatih Sebastian Hoeneß, pihak Stuttgart tetap tidak memperpanjang kontraknya secara permanen.